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基于博清生物科技儀器平臺(tái)的CYP2C19基因藥物基因組學(xué)檢測(cè)實(shí)驗(yàn)


更新時(shí)間:2025/09/08 文章來源:新格通達(dá) 瀏覽:2124 編輯:boqinglab 搜索看看


本實(shí)驗(yàn)采用博清生物科技(南京)有限公司系列儀器,建立CYP2C19基因多態(tài)性檢測(cè)方案。通過核酸提取儀、96孔熒光定量PCR儀及微孔板讀數(shù)儀構(gòu)建自動(dòng)化檢測(cè)流程,驗(yàn)證儀器在核酸提取效率、擴(kuò)增特異性及檢測(cè)靈敏度方面的性能。結(jié)果顯示:該平臺(tái)提取的人外周血基因組DNA純度(A260/A280)達(dá)1.82±0.05,PCR擴(kuò)增Ct值變異系數(shù)<3%,最低檢測(cè)限為10pg/μL,滿足臨床藥物基因組學(xué)檢測(cè)需求。

一、材料與方法

(一)儀器設(shè)備

    核酸提取儀:用于基因組DNA提取

熒光定量PCR儀:基因擴(kuò)增與分型

微孔板讀數(shù)儀:核酸純度驗(yàn)證

超純水一體機(jī):試劑配制與樣本稀釋

(二)實(shí)驗(yàn)方法

1、樣本處理:取200μL人外周血樣本,使用核酸提取儀(程序:裂解56℃ 10min,洗滌3次,洗脫50μL)提取基因組DNA;

2、核酸質(zhì)控:微孔板讀數(shù)儀檢測(cè)A260/A280比值及濃度,篩選合格樣本(濃度≥50ng/μL,A260/A280 1.7-1.9);

3、PCR擴(kuò)增:反應(yīng)體系20μL(含DNA模板2μL,CYP2C19*2/*3引物探針混合液10μL),96孔PCR儀運(yùn)行程序:95℃預(yù)變性3min;95℃ 15s,60℃ 30s(40循環(huán)),F(xiàn)AM/VIC通道采集信號(hào);

4、數(shù)據(jù)分析:通過儀器自帶軟件進(jìn)行Ct值計(jì)算與基因型判讀。

二、結(jié)果

(一)核酸提取效率

1、純度:30份樣本A260/A280均值1.82±0.05,合格率100%;

2、回收率:平均提取量(82.6±7.3)ng/200μL血,回收率達(dá)85.3%;

3、重復(fù)性:批內(nèi)CV=2.1%,批間CV=3.5%(n=5)。

(二)儀器協(xié)同性

1、提取-擴(kuò)增全流程耗時(shí)≤2.5h,較傳統(tǒng)手工操作縮短40%;

2、超純水機(jī)供水水質(zhì)穩(wěn)定,連續(xù)使用30天電阻率無波動(dòng)。

三、討論

(一)儀器性能優(yōu)勢(shì)

1、核酸提取儀采用磁珠法自動(dòng)化操作,避免交叉污染,溫控精度±0.25℃確保裂解效率;

2、96孔PCR儀六通道設(shè)計(jì)支持多重檢測(cè),±0.25℃控溫精度保障擴(kuò)增特異性;

3、微孔板讀數(shù)儀線性PMT技術(shù)提升低濃度樣本檢測(cè)靈敏度。

(二)應(yīng)用價(jià)值

1、該平臺(tái)可推廣至CYP2C19基因指導(dǎo)的氯吡格雷用藥監(jiān)測(cè),符合個(gè)體化醫(yī)療需求;

2、儀器操作界面簡(jiǎn)潔,支持20000條結(jié)果存儲(chǔ),便于實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)管理。

(三)改進(jìn)方向

1、建議增加樣本前處理模塊,拓展組織樣本檢測(cè)能力;

2、需進(jìn)一步驗(yàn)證儀器在高濕度環(huán)境(>80%RH)下的穩(wěn)定性。

博清生物科技(南京)有限公司儀器平臺(tái)(核酸提取儀、96孔熒光定量PCR儀、微孔板讀數(shù)儀)在CYP2C19基因檢測(cè)中表現(xiàn)出高提取效率、高擴(kuò)增特異性及良好重復(fù)性,可滿足臨床科研級(jí)藥物基因組學(xué)檢測(cè)需求,具備臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用潛力。


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